1、使用土地使用权为了正确反映事业单位预算执行情况以及财务状况，事业单位应对所拥有的土地使用权等无形资产进行摊销。其控制要点有两个方面：一是各单位应采取直线法对无形资产的摊销。其摊销年限根据《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》规定最高年限为50年。《事业单位会计制度》规定：“事业单位应当按照如下原则确定无形资产的摊销年限：法律规定了有效年限的，按照法律规定的有效年限作为摊销年限；法律没有规定有效年限的，按照相关合同或单位申请书中的受益年限作为摊销年限；法律没有规定有效年限、相关合同或单位申请书也没有规定受益年限的，按照不少于10年的期限摊销”。二是进行账务处理。根据每期计算的摊销额，借记“非流动资产基金———无形资产”科目，贷记“累计摊销”科目；如果是经营活动用地则直接借记“经营支出”科目或“生产成本”科目，贷记“累计摊销”科目。
2、转让土地使用权事业单位土地使用权的转让一般有两种情况：一是无偿划拨，各单位在注销“无形资产——土地使用权”账面余额的同时，再把划拨过程中所发生的相关费用，直接计入“其他支出”账户。二是有偿转让。第一应向主管部门、财政部门办理审批手续并列入年度预算。第二应向县级以上土地管理部门办理报批，并与受让方签订《国有土地使用权转让合同》。第三计算因转让土地使用权而应缴纳缴纳土地、契税、营业税等有关税费。第四进行账务处理。如果事业单位转让经营活动用地，其转让收入以及转让过程中发生的费用，则应通过“经营收入”“经营支出”等科目核算；因转让土地使用权而应缴纳的各种税费一般通过“应缴税费”科目核算。事业单位的是归国资委管理的，单位只享有使用权而不是拥有权。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第十二条土地使用权出让最高年限按下列用途确定：（一）居住用地七十年；（二）工业用地五十年；（三）教育、科技、文化、卫生、体育用地五十年；（四）商业、旅游、娱乐用地四十年；（五）综合或者其他用地五十年。《农村土地承包法》第二十一条耕地的承包期为三十年。草地的承包期为三十年至五十年。林地的承包期为三十年至七十年。前款规定的耕地承包期届满后再延长三十年，草地、林地承包期届满后依照前款规定相应延长。
